به گزارش خبرنگار جی پلاس، امام خمینی (س) در شانزدهم تیر ماه سال 58 مطابق با دوازدهم شعبان سال 99 در حکمی خطاب به حجت الاسلام و المسلمین سید محمد جعفری ورامینی بر تسریع در رفع مشکلات زندانیان زندان قصر تاکید کردند و از وی خواستند تا به تهران بازگردد. متن حکم امام به شرح زیر است:
"بسمه تعالی
12 شعبان 99
جناب مستطاب سیدالاعلام و ثقة‌الاسلام و المسلمین آقای حاج سید محمد جعفری ورامینی ـ دامت افاضاته
با توجه به وضع موجود زندان قصر، لازم است جنابعالی مجدداً به تهران مراجعت نموده و از نزدیک وضع زندانیان را بررسی کنید و نسبت به امور رفاهی ایشان، همانند گذشته، سعی و کوشش نمایید؛ و در تسریع رسیدگی به اتهامات ایشان با قضات و بازپرسان محترم همکاری های لازمه را بنمایید. از خدای تعالی موفقیت همگان را خواستارم.
روح اللّه الموسوی الخمینی"