به گزارش خبرنگار جی پلاس، امام خمینی (س) در سوم تیرماه سال 64 در نامه ای خطاب به شهید حجت الاسلام و المسلمین شیخ فضل الله محلاتی بر لزوم رعایت احترام نمایندۀ امام خمینی در سپاه پاسداران تاکید کردند. متن نامه ایشان به شرح زیر است:
"بسمه تعالی
جناب حجت الاسلام آقای محلاتی ـ دامت افاضاته
آقای شمخانی که به گفتۀ جنابعالی و بعض دیگر که با ایشان آشنا هستند شخص صالح و متعهدی هستند در نامه ای که نوشته اند از آنچه واقع شده اظهار تأسف کرده و پوزش خواسته اند. ان شاء اللّه تعالی جناب عالی آنچه که گذشته است نادیده گرفته و با ایشان و سایر برادران سپاهی چون گذشته برادرانه رفتار نمایید. فرزندان عزیز سپاهی باید توجه داشته باشند که جناب آقای محلاتی نمایندۀ محترم اینجانب شخصی مجاهد، صالح و امتحان داده هستند و حفظ احترام ایشان و توجه به رهنمایی ایشان لازم است. از خداوند تعالی توفیق همگان را در خدمت به اسلام و جمهوری اسلامی خواهانم. والسلام علیکم و رحمة اللّه.
3/4/64
روح اللّه موسوی الخمینی"