به گزارش خبرنگار جی پلاس، امام خمینی (س) در هفتم اردیبهشت ماه سال 63 در پیامی به مناسبت شهادت حجت الاسلام و المسلمین حاج شیخ مهدی شاه آبادی، پیامی خطاب به ملت ایران در تجلیل از این شهید والامقام صادر کردند. متن پیام امام به شرح زیر است:
"بسم اللّه الرحمن الرحیم
إناللّه و إِنّاإلیه راجعون
با کمال تأسف و تأثر شهادت استادزادۀ محترم،[1] جناب حجت الاسلام، آقای آقا شیخ مهدی شاه‌آبادی، را به پیشگاه معظّم حضرت بقیة‌اللّه، أرواحنا لمقدمه الفداء، تبریک و تسلیت عرض می کنم. مبارک باد بر آن حضرت چنین فداکاران و جانبازان در راه هدف بزرگ و اسلام عزیز، که با شهادت افتخارآمیز خود ملت عظیم‌الشأن ایران، بویژه روحانیت عالیقدر، را سرفراز می نمایند. این شهید عزیز علاوه بر آنکه خود مجاهدی شریف و خدمتگزاری مخلص برای اسلام بود و در همین راه به لقاءاللّه پیوست، فرزند برومند شیخ بزرگوار ما بود، که حقاً حق حیات روحانی به اینجانب داشت، که با دست و زبان از عهدۀ شکرش برنمی‌آیم. از خداوند متعال برای این شهید سعید و سایر شهدای در راه اسلام رحمت در جوار خود، و برای فامیل معظّم و حضرات آقازادگان محترم شاه‌آبادی، دامت افاضاتهم، صبر و اجر عظیم خواستارم.
روح اللّه الموسوی الخمینی"
1 ـ آقای میرزا محمد علی شاه‌آبادی، پدر شهید مهدی شاه‌آبادی، از عارفان وارسته بود که امام خمینی سالها از محضر ایشان کسب فیض کرده است.