در پی شهادت آیت الله سید مصطفی خمینی در نجف اشرف امام خمینی(س) اعلامیه ای خطاب به مسلمین ایران و جهان درباره شهادت منتشر کرد که در عین اختصار بیانگر عشق و علاقه فراوان ایشان به فرزند بزرگ و شاگرد و مرید تاثیرگذارشان هست. متن کامل این پیام بدین شرح است:
یادبود [: اعلامیه به مسلمین ایران و جهان درباره شهادت مصطفى خمینى]
زمان: 1 آبان 1356/ 9 ذى القعده 1397
مکان: نجف
موضوع: یادداشت تاریخ شهادت آقاى سید مصطفى خمینى
بسمه تعالى
إنا لله و إنا إلیه راجعون
در روز یکشنبه نهم شهر ذى القعدة الحرام 1397 مصطفى خمینى، نور بصرم و مُهجَه «1» قلبم، دار فانى را وداع کرد و به جوار رحمت حق تعالى رهسپار شد.
«اللهم ارحمه و اغفر له و أسکنه الجنة بحق اولیائک الطاهرین- علیهم الصلاة و السلام»
1- خون، روح، روان
منبع: صحیفه امام، ج3، ص 233