به گزارش خبرنگار جماران، اول آبان ماه سال 56 بود که حاج آقا مصطفی خمینی در نجف اشرف به طرز مشکوکی به شهادت رسید. ایشان طبق وصیت نامه امام، وصی بودند و بعد از شهادتشان، امام خمینی(س) در تاریخ هجدهم آذر ماه همان سال مطابق با بیست و هفتم ذی الحجه 1397 چند نفر دیگر از جمله آقایان شیخ حبیب الله اراکی، آقای رضوانی و ... را به عنوان وصی خود انتخاب کردند. متن این وصیت نامه به شرح زیر است:
«بسم اللّه الرحمن الرحیم
به تاریخ 27 شهر ذی‌الحجه 1397
اینجانب روح‌اللّه موسوی خمینی، در حال صحت و سلامت، وصی خود قرار دادم حضرات حجج اسلام آقای آقا شیخ حبیب اللّه اراکی و آقای رضوانی خمینی و آقای آقا سید عباس خاتم یزدی و آقای آقا سید جعفر کریمی ـ دامت افاضاتهم ـ را در امور مربوطۀ به وجوه شرعیه که نزد اینجانب است. تمام وجوهی که نزد خودم و نزد آقای خلخالی[1]است وجوه شرعیه است و یک فلس[2 ]آن مال شخصی که مربوط به ورثه شود نیست مگر یک پاکت که مختصر وجهی در آن است و پشتش نوشته شده: «مال شخص خودم است». آقایان این وجوه را به طور شهریه، به هر نحو صلاح می دانند، در حوزه های علمیه مصرف نمایند. صورت وجوه در دفتر اینجانب موجود است؛ و چون وجوه بتدریج می رسد و صرف می شود نمی توانم صورت را بدهم. و اگر عائلۀ اینجانب و مرحوم مصطفی ـ رحمه اللّه تعالی ـ خواستند نجف بمانند، به آنها به مقدار متعارف مخارج بدهند. از خداوند تعالی توفیق و تأیید آقایان را خواستارم. امید است کمال احتیاط را در امور مراعات فرمایند. والسلام علیکم و رحمة اللّه.[3]
روح اللّه الموسوی الخمینی
1 ـ آقای نصراللّه خلخالی، مسئول امور مالی امام خمینی در نجف.
2 ـ واحد پول خرد در کشور عراق.
3 ـ امام خمینی پشت پاکت چنین مرقوم فرموده‌اند: «این پاکت نزد جناب آقای آقا سید جعفر کریمی محفوظ باشد، و پس از فوت اینجانب، آن را باز کنند و مطالعه نمایند. روح اللّه الموسوی الخمینی».