به گزارش جماران، با سفر این مرجع تقلید به مشهد، سلسله جلسات علمی هر روز رأس ساعت ۱۱ صبح با حضور طلاب و محققین در محل اقامت ایشان واقع در خیابان طبرسی، کوچه جوادیه برگزار و تا اذان ظهر ادامه دارد.
دیدار با علما، بزرگان، عموم طلاب و مردم و اقامه نماز مغرب و عشا در مسجد ملاهاشم از دیگر برنامه‌های آیت الله شبیری زنجانی در مشهد می‌باشد.