باهنر در مورد ماجرای میرسلیم و قالیباف و پرونده ای که مطرح است گفت: «آقای میرسلیم اگر مستنداتی دارد، باید به دادگاه ارائه بدهد و مصاحبه هم نکند. کسی رفته و رئیس مجلس شده و حرمت دارد. در مقابل قانون همه یکی هستند اما قبل از اینکه دادگاه و پرونده و سندی باشد، شخصی حرفی را در رسانه بزند، به نظر من کار مدبرانه‌ای نبود.»
میرسلیم از همان انتخابات 96 یک بازی را با طیف قالیباف شروع کرد. از همان زمان بحث تخلفات شهرداری را پیش کشید و تصور می‌کرد با مانور بر آن شانس خود را برای پیروزی افزایش می‌دهد. این بازی را در آستانه انتخابات مجلس که با قالیباف وارد یک فهرست شد، کنار گذاشت؛ اما در مجلس وقتی هیچ پستی به او نرسید، دوباره بازی را شروع کرد.
یک عضو هیئت رئیسه مجلس شورای اسلامی در پاسخ به سوالی مبنی بر شکایت رئیس مجلس از مصطفی آقا میرسلیم نماینده تهران اظهار داشت: این موضوع و ادعای آقای میرسلیم درباره رئیس مجلس در هیأت نظارت بر رفتار نمایندگان مورد بحث قرار گرفت.