شیوه نامه انضباطی سال 98 در مواردی از قبل بهتر شده است.مثل اینکه بر اساس این شیوه نامه تجمع بدون مجوز تخلف نیست و تغییر رشته دانشجو را هم از تنبیهات حذف کرده اند.ولی در مواردی هم بدتر شده است. مثلا در شیوه نامه 98 محرومیت ها بر اساس ماه هم پیش بینی شده است.
وزیر علوم، تحقیقات و فناوری گفت: موارد مورد اختلاف در شیوه‌نامه انضباطی تا زمان اصلاح برخی نواقص، بر اساس روح حاکم بر قانون اساسی و منشور حقوق شهروندی (ابلاغ شده از سوی رئیس جمهوری) به نفع دانشجویان تفسیر شود.
معاون حقوقی رئیس جمهوری گفت: شیوه نامه قبلی را اصلاح می کنیم. چون شیوه نامه انضباطی در همه کارها وجود دارد. مثلا من عضو هیات علمی دانشگاه تهران هستم و یک قانون انتظامی در دانشگاه وجود دارد که ما باید قوانین و دستورالعمل ها را رعایت کنیم. بنابراین برای کسی که کارمند است قانون تخلفات اداری وجود دارد که باید آیین نامه ها و دستورالعمل های اداری را رعایت کند.